Les 45 communes du canton de Genève sont membres de l’Association des communes genevoises. Ses organes, dont les prérogatives sont déterminées par les statuts de l'ACG, en assurent la gouvernance.
L'Assemblée générale, organe suprême de l'ACG, réunit toutes les communes, représentées par leurs exécutifs. Les autres organes de l'ACG et notamment son Comité (organe exécutif), sont composés de magistrates et de magistrats communaux choisis par leurs pairs pour assurer une représentation géographique et démographique équitable des communes.
Pour accomplir ses missions, l'ACG dispose de ressources principalement constituées des cotisations de ses membres, ainsi que des prestations qu'elle facture, principalement auprès des entités intercommunales dont elle assure la gestion administrative et financière.
Enfin, les organes de l'ACG bénéficient de l'appui d'un Secrétariat permanent, placé sous la responsabilité d'une direction.